Integrative Strukturbiologie

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Die Untersuchung der Architektur komplexer makromolekularer Anordnungen in ihrem ursprünglichen Kontext erfordert die Integration traditioneller strukturbiologischer In-vitro-Methoden wie Röntgenkristallographie und Single-Particle-Elektronenmikroskopie mit Ansätzen, die die Datenintegration und Strukturanalyse in situ erleichtern, wie Kryo-Elektronentomographie und Subtomogramm Mittelung und Vernetzung der Massenspektrometrie. Wir entwickeln dazu ständig neue Methoden.

Ausgewählte Publikationen

Mosalaganti, S.; Obarska-Kosinska, A.; Siggel, M.; Taniguchi, R.; Turoňová, B.; Zimmerli, C. E.; Buczak, K.; Schmidt, F. H.; Margiotta, E.; Mackmull, M.-T. et al.

AI-based structure prediction empowers integrative structural analysis of human nuclear pores.

Science. 2022 June; 376 (6598), doi: 10.1126/science.abm9506.

DOI

Zimmerli, C. E.; Allegretti, M.; Rantos, V.; Goetz, S. K.; Obarska-Kosinska, A.; Zagoriy, I.; Halavatyi, A.; Hummer, G.; Mahamid, J.; Kosinski, J.; Beck, M., et al.

Nuclear pores dilate and constrict in cellulo.

Science. 2021 Nov; 374 (6573). doi:10.1126/science.abd9776.

DOI

Turonova B, Hagen WJ, Obr M, Kräusslich HG, Beck M.

Benchmarking tomographic acquisition schemes for high-resolution structural biology.

Nature Communications. 2020. doi: 10.1038/s41467-020-14535-2.

DOI

Kosinski J, Mosalaganti S, von Appen A, Teimer R, DiGuilio AL, Wan W, Bui KH, Hagen WJ, Briggs JA, Glavy JS, Hurt E, Beck M.

Molecular architecture of the inner ring scaffold of the human nuclear pore complex.

Science. 2016 Apr 15;352(6283):363-5. doi: 10.1126/science.aaf0643.

DOI

von Appen A, Kosinski J, Sparks L, Ori A, DiGuilio AL, Vollmer B, Mackmull MT, Banterle N, Parca L, Kastritis P, Buczak K, Mosalaganti S, Hagen W, Andres-Pons A, Lemke EA, Bork P, Antonin W, Glavy JS, Bui KH, Beck M.

In situ structural analysis of the human nuclear pore complex.

Nature. 2015 Oct 1;526(7571):140-143. doi: 10.1038/nature15381.

DOI

Kosinski J, von Appen A, Ori A, Karius K, Müller CW, Beck M.

Xlink Analyzer: software for analysis and visualization of cross-linking data in the context of three-dimensional structures.

J Struct Biol. 2015 Mar;189(3):177-83. doi: 10.1016/j.jsb.2015.01.014.

DOI